Seit dem Kampf gegen Malomyotismon sind einige Jahre vergangen. Die Digiwelt hat sich verändert. Es ist absolut friedlich in der Digiwelt geworden. Aus diesem Grund müssen die Digiritter nicht mehr in der Digiwelt kämpfen. Sie machen ihren Schulabschluss, beginnen zu studieren, oder beginnen mit ihrem ersten Job. Seit sie das letzte Mal in der Digiwelt waren wurden viele neue Kinder zu Digirittern und erkunden die Digiwelt nun zum ersten Mal und sammeln ihre ersten Erfahrungen.
Die Ruhe in der Digiwelt hält allerdings nicht ewig, was langsam deutlich wird. Eine Katastrophe jagt die Nächste und die Digiritter werden gebeten zurück zu kommen und zu helfen. Der Verantwortliche für die Katastrophen wurde noch nicht gefunden, doch die Macht der Dunkelheit scheint wieder anzuwachsen. Dörfer von Digimon werden zerstört, Digimon verschwinden... Nichts scheint mehr von dem gewonnenen Frieden übrig geblieben zu sein.
Digimon und Digiritter müssen wieder Seite an Seite zusammenarbeiten und kämpfen um herauszufinden, was in der Digiwelt los ist. Werden die Digiritter die Digiwelt ein weiteres Mal beschützen können? Werden sie herausfinden, was in der Digiwelt passiert?